五月，努尔哈赤又暗遣佑雷和伊沙穆，分别前往札鲁特右翼台吉达雅和色本两处。奉命监视右翼的札鲁特左翼台吉钟嫩和巴林左翼台吉昂安等，中途劫夺了佑雷、伊沙穆所带衣物。色本惧怕问罪，于是率部逃入科尔沁。科尔沁奥巴也惟恐得罪而不敢收留。色本台吉走投无路，只好投奔后金国主努尔哈赤。努尔哈赤得知内喀尔喀的很多台吉怀有归顺之心，但被所阻不敢轻举妄动。于是决定以武力相助欲附之台吉。经多次往来，努尔哈赤已争取了科尔沁奥巴为首的诸台吉。1624年二月，努尔哈赤遣巴克什、希福、库尔禅至科尔沁，在伊克唐噶哩坡(今科左中旗花土古拉苏木一带)与奥巴为首的诸台吉刑白马乌牛盟誓（《皇清开国方略》卷8）。此时，叔祖岱青台吉与不和，遂领所属锡纳明安鄂托克及其六子逃入科尔沁境内，受到奥巴洪台吉的保护。命弘吉剌特鄂托克齐赛诺延领兵追回岱青台吉。齐赛诺延深入科尔沁，斩杀了前来堵截的奥巴属下六台吉，取胜而返。1625年十一月，亲自率领内喀尔喀部分兵力，前往科尔沁奥巴洪台吉所在地格勒珠尔根城，围城问罪。努尔哈赤命三贝勒莽古尔泰、四贝勒皇太极率领5000名精锐骑兵，由农安塔前来援助奥巴，迫使撤走。内喀尔喀巴岳特鄂托克达尔汉巴图尔之子恩格德尔台吉欲归后金，因惧，不敢前移。努尔哈赤命诸贝勒率兵，移其部众于辽阳。

在此期间，努尔哈赤以札鲁特部人夺其使臣财务为借口，派阿巴泰、德格类等贝勒率领3000人，深入札鲁特左翼击斩了昂安台吉，尽获其妻孥人户畜产而去。面对后金统治者的军事压力，未能有效地组织各部与后金正面作战，客观上为后金提供了蚕食其外围各部的机会。

1626年

五月，努尔哈赤亲统大军，分兵八路进攻巴林部，击斩了该部台吉囊努克，收其畜产班师。巴林部的部分台吉率部逃入科尔沁境，归顺了努尔哈赤。同年十月，后金以札鲁特台吉鄂尔齐图等兵阻前往科尔沁的使臣为借口，由大贝勒代善、二贝勒阿敏率领万余兵马攻打了左翼札鲁特诸台吉，俘虏了巴克为首的14个台吉及人畜。随后，后金统治者又以武力迫使察哈尔所属阿剌克楚特鄂托克小台吉图尔济率属下百余户归附了后金。

1626年八月，后金国主努尔哈赤去世，其四子皇太极即位。皇太极登基后，加快了征服蒙古各部的步伐，三征。

皇太极以软硬兼施的手段，拉拢并征服了察哈尔部外围的内喀尔喀(巴林、札鲁特、巴岳特、乌齐叶特、弘吉剌特)和科尔沁部