将追求美好未来的希望，寄托在宇宙殖民地的生活，可是，地球统一联合政府，却假籍正义与和平之名，以压倒性的军事力量强行征服了各个殖民地
后殖民地时代（Afry）A..年——宇宙殖民地决定对依靠武力进行统治的地球统一联合实行“流星作战”
一部分反抗地球联合政府的殖民地居民，将伪装成流星的五台新型兵器送往地球的秘密行动，但是。。。这个计划早已经被地球联合政府给察觉到了
地球的某个无名海域内，一艘紫色的小型舰船正在这里穿梭着，正是幻影号，星耀和王留美来到这里已经有一年多了
一年前，星耀和王留美在各个殖民地旅行的时候，遇到了执行流星作战的五名MS的设计者，开发可飞行变形MS，以强大的爆烈步枪和飞翼为标志的飞翼高达的J博士、开发高性能，具有电子干扰机能的死神高达的G教授、开发出火力压制的重装高达的S博士、开发出装备着光束长柄刀和火焰喷射器的强力近战机体神龙高达的博士、开发出力量强劲，装甲厚重，行动灵活的沙漠高达的H博士。
刨去资料不详细的博士，剩下的四名都是在殖民地的领导者——希罗·唯被暗杀之后叛逃出Z，具有强烈的正义感的人。
除此之外，还有过去与他们共事，如今隐藏在地球之中的同样的顶级科研员霍华德
在和几人进行了一番交谈以后，星耀和王留美成为了五名流星作战成员的协助者，负责各个成员之间的联系和在暗中的支援
这时候，王留美传来了通讯，王留美在作战的一周前就去寻找霍华德了，所以幻影号上只有星耀一个人
“星耀，希罗好像出了一点意外，不过其他四位的情况一切正常”
“是吗，那做好收尾的工作吧”
“好的”
与此同时，地球的大气层内，一台蓝白色有着飞翼的机体正在和一台绿色的机体交战，蓝白色的机体是执行流星作战的飞翼高达，有着威力强大的爆烈步枪和优越的机动性，但此时却被一**合军的量产型MS里奥给牵制了
这台里奥的驾驶员是Z的上级特尉——积古斯·马吉斯，虽然都属于联合内部，但Z和联合军是不同的组织，联合政府武力的主体也还是联合军，而Z则是联合的特务部队，而联合的MS里奥、艾亚里斯、坎沙、派西斯、特拉哥斯等机体都是由Z这个组织所提供的技术还有机体
这时候，里奥抽出了机体上配备的光束军刀，高能的光束激发出粉色的光亮，在这接近